Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ell2Q3UKU1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ell2Q3UKU1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ell2Q3UKU1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms