Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc61Q3UJV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc61Q3UJV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms