Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sf3b2Q3UJB0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms