Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph3aQ3UFY4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph3aQ3UFY4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms