Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnft2Q3UF64 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms