Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trafd1Q3UDK1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trafd1Q3UDK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms