Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Otud5Q3U2S4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms