Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pag1Q3U1F9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pag1Q3U1F9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms