Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Smarca4Q3TKT4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Smarca4Q3TKT4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Smarca4Q3TKT4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms