Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc13Q3TIR1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc13Q3TIR1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms