Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfaip8l3Q3TBL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms