Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col24a1Q30D77 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col24a1Q30D77 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col24a1Q30D77 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms