Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdgfl1Q2VPR5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl1Q2VPR5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms