Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna5Q2MKA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna5Q2MKA5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms