Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim71Q1PSW8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim71Q1PSW8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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