Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
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Tdrd9Q14BI7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
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Tdrd9Q14BI7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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Tdrd9Q14BI7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
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Tdrd9Q14BI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
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Tdrd9Q14BI7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tdrd9Q14BI7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tdrd9Q14BI7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms