Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpusd2Q149F1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpusd2Q149F1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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