Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Perm1Q149B8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Perm1Q149B8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Perm1Q149B8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Perm1Q149B8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms