Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Spatc1Q148B6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Spatc1Q148B6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Spatc1Q148B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Spatc1Q148B6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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