Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bpifa6Q0VGU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Bpifa6Q0VGU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bpifa6Q0VGU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms