Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rtel1Q0VGM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rtel1Q0VGM9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rtel1Q0VGM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms