Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms