Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Lrriq1Q0P5X1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lrriq1Q0P5X1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Lrriq1Q0P5X1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lrriq1Q0P5X1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms