Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Vps8Q0P5W1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Vps8Q0P5W1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Vps8Q0P5W1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms