Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxc4Q08624 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc4Q08624 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms