Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnma1Q08460 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kcnma1Q08460 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kcnma1Q08460 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms