Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Calb2Q08331 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Calb2Q08331 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Calb2Q08331 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms