Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
AmbpQ07456 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AmbpQ07456 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms