Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdx4Q07424 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdx4Q07424 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms