Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfe2Q07279 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nfe2Q07279 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms