Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Fmn1Q05860 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Fmn1Q05860 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Fmn1Q05860 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms