Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox13Q04891 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox13Q04891 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms