Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox10Q04888 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sox10Q04888 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox10Q04888 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms