Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sox9Q04887 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sox9Q04887 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms