Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top1Q04750 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top1Q04750 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Top1Q04750 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms