Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snai1Q02085 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snai1Q02085 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms