Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly9Q01965 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ly9Q01965 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms