Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme2Q01768 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nme2Q01768 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nme2Q01768 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms