Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EgfrQ01279 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EgfrQ01279 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms