Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tcf7Q00417 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tcf7Q00417 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms