Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pax8Q00288 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax8Q00288 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax8Q00288 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms