Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psmb4P99026 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psmb4P99026 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms