Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AlkP97793 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AlkP97793 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AlkP97793 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AlkP97793 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AlkP97793 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AlkP97793 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AlkP97793 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AlkP97793 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AlkP97793 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AlkP97793 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AlkP97793 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AlkP97793 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AlkP97793 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AlkP97793 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AlkP97793 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AlkP97793 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AlkP97793 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AlkP97793 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AlkP97793 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
AlkP97793 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AlkP97793 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AlkP97793 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AlkP97793 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AlkP97793 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AlkP97793 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
AlkP97793 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
AlkP97793 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AlkP97793 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
AlkP97793 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AlkP97793 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AlkP97793 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AlkP97793 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AlkP97793 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AlkP97793 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AlkP97793 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms