Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx3-1P97436 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nkx3-1P97436 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms