Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrkdcP97313 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrkdcP97313 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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