Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp2P97299 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp2P97299 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms