Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SgcdP82347 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SgcdP82347 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SgcdP82347 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms