Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabpb2P81069 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabpb2P81069 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabpb2P81069 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms