Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Irx1P81068 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx1P81068 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx1P81068 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms