Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb6P70689 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb6P70689 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms